根據不同的生物研究和防疫要求，生物安全柜可分為一級、二級和三級三大類，其中一類生物安全柜可保護工作人員和環境而不保護樣品；二類生物安全柜也是如今應用最廣泛的柜型，除了具有一類產品的作用之外，還能夠保證試驗品不受外界空氣的污染，所有的二級生物安全柜都可提供工作人員、環境和產品的保護。
三級生物安全柜是為4級實驗室生物安全等級而設計的，是目前世界上最高安全防護等級的安全柜。柜體完全氣密，100%全排放式，所有氣體不參與循環，工作人員通過連接在柜體的手套進行操作，俗稱手套箱(Golve box)，試驗品通過雙門的傳遞箱進出安全柜以確保不受污染，適用于高風險的生物試驗。
生物安全柜的標準很嚴格，不過目前國內還沒有統一的國家標準，現有的標準都是采用歐盟標準、美國標準及各個生產廠家的標準等等，所以在安裝時喝之后一段時間，國家都會對每一臺生物安全柜進行性能檢測。
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